16S+ITS測序的原理和用途
更新時(shí)間：2021-09-01 點(diǎn)擊次數：1836
16S+ITS測序是對特定長(cháng)度的PCR產(chǎn)物或者捕獲的片段進(jìn)行測序，目前主要是應用高通量測序技術(shù)對特定環(huán)境中特定遺傳物質(zhì)進(jìn)行測序。大多數天然微生物都不能通過(guò)傳統的分離培養方法進(jìn)行分離和克隆，這對于天然微生物定性和定量，探索微生物多樣性是嚴重的挑戰。擴增子測序可以克服傳統分離培養的弱點(diǎn)，對樣品中的微生物進(jìn)行定性和定量，目前在微生物多樣性檢測中廣泛應用。 16S+ITS測序的原理和用途：
16SrDNA測序：16SrDNA是編碼16SrRNA的基因，存在于所有細菌基因組。其既能體現不同菌屬之間的差異，又能利用測序技術(shù)較容易地得到其序列，目前被廣泛用于病原菌的檢測和鑒定。它的可變區經(jīng)常用于不同微生物群落的屬或種系統進(jìn)化分類(lèi)。
ITS測序：在真核生物中，18SrDNA和28SrDNA轉錄間隔序列稱(chēng)為ITS區。由于其是非轉錄區，承受的選擇壓力較小，變異強;屬于中度保守區域，利用它可研究種及種以下的分類(lèi)階元。
16S+ITS測序技術(shù)優(yōu)勢：
較低的成本：與宏基因組測序相比，對測序深度的要求更低，性?xún)r(jià)比較高；
鑒定效率高：與克隆或培養等傳統鑒定方法相比，微生物群16S/ITS測序是一種更快、更準確的方法。
高靈敏度：可以鑒定出豐度極低的細菌。
雙區檢測：針對一個(gè)或多個(gè)可變區域的靈活性，能夠進(jìn)行更長(cháng)的序列讀取，并能夠對菌落進(jìn)行更準確的分析。
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