NGS工作流程可以分為這三步
更新時(shí)間:2021-11-18 點(diǎn)擊次數:2863
NGS工作流程通常從樣品制備步驟開(kāi)始,其成功與否對確??煽康臏y序結果至關(guān)重要。為了獲得足夠數量和質(zhì)量的核酸,需要對樣品進(jìn)行有效和均勻的研磨。機械裂解,更具體地說(shuō)是珠磨式技術(shù),被認為是樣品研磨均勻化的黃金標準。
NGS工作流程可以分為這三步:
文庫制備:為了節省資源,可以將多個(gè)文庫混合在一起,在同一運行中進(jìn)行測序——該過(guò)程稱(chēng)為多重分析。接頭連接過(guò)程中,標簽序列(或說(shuō)“條形碼”)會(huì )添加到每個(gè)文庫。這些條形碼可以在數據分析過(guò)程中區分文庫。這步是為獲取足夠量的/目的的/前期適合上機測序而標準處理DNA。其程序主要有:片段化,連接,擴增。
測序:在邊合成邊測序(SBS)過(guò)程中,化學(xué)修飾的核苷酸會(huì )通過(guò)天然的互補性與DNA模板鏈結合。每個(gè)核苷酸都有一個(gè)熒光標記和一個(gè)可逆終止子,后者可以阻止下一個(gè)堿基的摻入。熒光信號可以指示出加入的核苷酸種類(lèi),終止子被切割后,下一個(gè)堿基才可以繼續結合。其實(shí)就是把把采集到的樣品分離提純成需要的基因組DNA,再把這些DNA打成小片段,然后再在這些DNA小片段兩頭接上識別標記和測序接頭,最后再通過(guò)基因捕獲技術(shù)篩選出目的DNA,根據需求PCR擴增。然后,就可以上機測序了。上機測序的過(guò)程就是讀取這些。
數據分析:可以使用直觀(guān)的數據分析應用程序來(lái)分析NGS數據,無(wú)需進(jìn)行生物信息學(xué)培訓或另外雇傭實(shí)驗室人員。這些工具可以進(jìn)行序列比對、變異檢出、數據可視化或解讀。